Adeus Conda, bem vindo Pixi!

À medida que a tecnologia vai progredindo, nossos programas de estimação frequentemente ficam obsoletos. Após muitos anos utilizando e recomendando o conda (e mais recentemente o mamba) para meus alunos e colegas de trabalho, estou (novamente) migrando para um novo gerenciador de pacotes: o Pixi.

Trata-se de um gerenciador criado pelos mesmos desenvolvedores do mamba. O mamba, caso você nunca tenha utilizado, é uma versão extremamente mais rápida do gerenciador conda, e serve como uma substituição imediata (inclusive, você pode instalá-lo como um pacote dentro do conda, sem necessidade de migrar nada, e se beneficiar da melhoria em velocidade em resolução de dependências).

Mas se o mamba é tão bom, porque migrar novamente? Realmente, não existe uma grande necessidade, e para ser sincero, o mamba ainda deve ser, na minha opinião, a primeira escolha de novatos, ou grupos que já estão acostumados com o conda, uma vez que é um modelo mais estabelecido de gerenciamento de pacotes, e o Pixi ainda estar em versão beta. Abaixo vou elencar os motivos pelos quais sinto que o Pixi (ou programas semelhantes) serão o futuro do gerenciamento de programas em bioinfo.

Um ambiente por projeto

Contrastando com o conda/mamba, o ambiente de gerenciamento do Pixi não é global, mas é restrito ao projeto (ou a uma pasta) na qual a instalação dos pacotes ocorre. Toda a organização fica num diretório .pixi e gerenciado por um arquivo de texto pixi.toml, onde você define os pacotes de interesse (ou na linha de comando através do comando pixi add [pacote]). Nada de ficar lembrando o nome de ambientes, rode os programas através do comando pixi run e pronto!

Instalação e desinstalação simplificada

Para apagar um ambiente, basta usar o comando pixi clean ou apagar a pasta pixi do projeto e recomeçar. Similarmente, o próprio Pixi é um simples binário, apagá-lo já o remove completamente do seu sistema

Velocidade

Incrivelmente, o Pixi consegue ser mais rápido que o mamba para resolver as dependências entre programas, graças ao seu uso de otimizações em Rust, uma linguagem de programação bastante eficiente. Para programas em python, ele utiliza o uv, o mais rápido gerenciador de dependências para python atualmente.

Mas como lido com programas que precisam de diferentes versões de pacotes? No arquivo pixi.toml você consegue criar “sub-ambientes” com versões e pacotes específicos e chamá-los com a flag --environment.

Instalação e gerenciamento global de pacotes

Às vezes precisamos de programas globais, ou seja, que são utilizados para todos os projetos, ou até mesmo para facilitar nossa vida. Se você usa um MacBook, deve conhecer o homebrew. O pixi global install age de forma semelhante, mas funciona em qualquer sistema operacional.

Conclusão

Como disse no início, o Pixi ainda está em versão beta, e embora esteja estável o suficiente para ter completamente substituído outros gerenciadores no meu dia a dia, talvez ainda seja cedo para você migrar. A boa notícia é que ele pode ser instalado junto ao conda/mamba sem conflitos, então você pode testá-lo aos poucos sem muitos riscos! Foi o que eu fiz no começo!